Merci-i taklid sisteminde değişim yaşandı.
Merci-i taklid sistemi Humeyni döneminde yetkileri siyasi alana genişletilecek şekilde değşitirildi.
Humeyni'nin ardından, merci-i taklid sistemi bir sorun haline geldi. Humeyni'nin yerine geçen Hamaney, bir müçtehit olmasına rağmen henüz bir merci olarak tanımlanmıyordu. Bu nedenle, 28 Temmuz 1989'da Anayasa'nın 107. Maddesi referandum yoluyla değiştirilerek, rehberin tanınmış bir merci olma şartı kaldırıldı. Daha sonra Ayetullah Hamaney, İran'da birçok alimin desteğiyle merci ilan edildi, ancak teknik uzmanlık konularında tavsiyelerde bulunacak bir fetva konseyi oluşturarak yeni bir sistem oluşturdu. İran'da merci-i taklidin seçimi, yetkileri, devletle ve diğer mercilerle ilişkileri, Şii düşünce çevrelerinde hala etkin bir şekilde tartışılmaktadır.
